Un hombre de Hesper llamado Henry Thompson intentó correr hasta Lawrence para avisar a la gente de allí de que se avecinaba un ataque. Pudo correr hasta Eudora antes de estar demasiado cansado. Un hombre desconocido que viajaba en una caravana se cruzó con Thompson para preguntarle si necesitaba ayuda. Thompson le dijo que había corrido todo el camino desde Hester y que necesitaba avisar a Lawrence. Thompson y el hombre consiguieron que algunas personas de Eudora fueran a Lawrence para avisar de un ataque. Llegaron demasiado tarde.
Unos 450 guerrilleros se acercaron a Lawrence poco después de las 5 de la mañana. Una de las primeras muertes fue la de un pastor, Samuel S. Snyder. Estaba fuera ordeñando sus vacas cuando los guerrilleros le dispararon. Su primer objetivo era llegar a la Casa Eldridge, un gran hotel de ladrillo en el centro de Lawrence. Se hicieron con el control del edificio (que se convirtió en el cuartel general de Quantrill durante el asalto). Después, los hombres de Quantrill se dividieron en grupos más pequeños que se extendieron por todo Lawrence. Durante las siguientes cuatro horas, los asaltantes saquearon y quemaron el 25% de los edificios de Lawrence. Quemaron todos los negocios excepto dos. Saquearon la mayoría de los bancos y tiendas de la ciudad. Mataron a más de 150 personas. Todas las víctimas eran hombres y niños. Algunas fuentes dicen que murieron 183 personas. Una fuente de 1897 dice que entre los muertos había 18 de 23 reclutas del ejército sin formación. A las 9 de la mañana, los asaltantes abandonaban Lawrence.
El alcalde George W. Collamore se escondió en el pozo de su familia para que los guerrilleros no lo encontraran. Sin embargo, prendieron fuego a su casa y murió al respirar el humo. Después de la masacre, un amigo de Collamore llamado Lowe se metió en el pozo para encontrarlo. La cuerda a la que se aferraba se rompió y también murió en el pozo.
Varios grupos de guerrilleros llegaron a juzgar la casa de Louis Carpenter. Le quitaron todo lo que tenía, pero él les convenció de que no le mataran ni quemaran su casa. Otro grupo de guerrilleros vino y le preguntó de dónde era. Dijo que era de Nueva York. Uno de los guerrilleros le dijo: "Son ustedes, los neoyorquinos, los que están haciendo todas las travesuras". Cuando el guerrillero sacó su revólver para disparar a Carpenter, éste volvió corriendo a su casa. Los guerrilleros le persiguieron hasta el interior de su casa, subieron las escaleras y volvieron a bajarlas, disparándole. Carpenter corrió al sótano, pero estaba sangrando. Le encontraron y los guerrilleros le persiguieron hasta el exterior y le dispararon. Su esposa Mary utilizó su cuerpo para protegerlo. Un guerrillero la rodeó para encontrar un lugar donde disparar por debajo de ella. Le levantó el brazo y apuntó con su revólver debajo de ella. Disparó su arma de manera que ella pudo ver cómo la bala entraba en la cabeza de Carpenter. Entonces, los guerrilleros prendieron fuego a la casa. Sin embargo, la hermana de su esposa pudo detener el fuego.
George Burt estaba de pie cerca de una valla cuando un guerrillero se le acercó. El guerrillero le pidió todo su dinero. Cuando Burt le dio al guerrillero su libro de bolsillo, el guerrillero lo tomó con una mano y le disparó a Burt con la otra.
Un hombre alemán llamado Phillip Albach estaba enfermo, tumbado en la cama. Los guerrilleros exigieron a la familia que desalojara la casa para poder quemarla. La familia sacó a Albach al exterior en un colchón y lo acostó en el patio. Cuando los guerrilleros salieron de la casa, lo mataron en su cama.
El reverendo Hugh Dunn Fisher intentó huir de su casa con sus dos hijos. Fisher estaba enfermo, por lo que no pudo huir. Volvió a entrar en su casa y se escondió bajo las escaleras del sótano. Cuando unos guerrilleros entraron en la casa, exigieron a su esposa Elizabeth que les dejara mirar en el sótano. No pudieron ver a Fisher en la oscuridad. Cuando salieron, prendieron fuego a la casa y la vieron arder. Esperaban que si Fisher estaba escondido dentro, saliera corriendo para poder matarlo. Elizabeth cubrió a Fisher con un vestido viejo y una alfombra, y lo sacó de la casa. Lo cubrió con la alfombra y el vestido para que pareciera que simplemente intentaba salvar sus pertenencias del fuego. Fisher se escondió bajo la alfombra hasta que los guerrilleros se fueron y toda la familia sobrevivió.
Los asaltantes querían vengarse, así que tenían una lista de personas que querían matar y de edificios que querían quemar. James H. Lane era el primero de la lista. Lane era un líder militar y partidario de los Jayhawkers. Lane escapó corriendo por un campo de maíz mientras llevaba puesto su camisón. John Speer era uno de los mayores partidarios políticos de Lane. Lane había metido a Speer en el negocio de los periódicos. Speer también estaba en la lista. Charles L. Robinson, primer gobernador de Kansas y abolicionista, puede haber estado también en la lista. Sin embargo, no fue asesinado.
Muchos dijeron que la decisión de Quantrill de matar a chicos jóvenes fue una parte muy mala del ataque. Generalmente se dice que Bobbie Martin fue la persona más joven que murió. Algunos relatos del ataque dicen que podría tener entre diez y doce años, pero otros dicen que tenía catorce años. La mayoría de las fuentes dicen que llevaba un uniforme de soldado de la Unión o ropa hecha con el uniforme de su padre, pero otras dicen que llevaba un mosquete y cartuchos. La mayoría de los guerrilleros de Quantrill eran adolescentes. Uno de los más jóvenes era Riley Crawford. Tenía trece años cuando su madre lo llevó a Quantrill después de que los soldados de la Unión dispararan a su marido y quemaran su casa.
El Kansas State Journal fue el primer periódico de Lawrence que siguió publicando después del ataque. Publicaron su primer ejemplar el 1 de octubre de 1863. En él se decía que todos los negocios de Lawrence habían sido saqueados; todos los negocios, excepto cinco, habían sido quemados; todas las casas de Lawrence habían sido saqueadas; 160 hombres y niños habían muerto. El Leavenworth Daily Conservative, el 23 de agosto de 1863, decía que los guerrilleros habían causado daños por valor de 2.000.000 de dólares y habían robado 250.000 dólares en dinero.
