Botánica
Darwin creó la Sociedad Botánica de Lichfield para traducir del latín al inglés las obras del botánico sueco Carolus Linnaeus. Esto le llevó siete años. El resultado fueron dos publicaciones: A System of Vegetables, entre 1783 y 1785, y The Families of Plants, en 1787. En estos volúmenes, Darwin acuñó muchos de los nombres de plantas en inglés que utilizamos hoy en día.
A continuación, Darwin escribió Los amores de las plantas, un largo poema, que era una interpretación popular de las obras de Linneo. Darwin también escribió Economía de la vegetación, y ambos se publicaron juntos como El jardín botánico.
Su último poema largo, el Templo de la Naturaleza, se publicó después de su muerte, en 1803. Se considera su mejor obra poética. Se centra en su propia teoría de la evolución recién concebida, trazando la progresión de la vida desde los microorganismos hasta la sociedad civilizada.
Zoología
La obra científica más importante de Darwin es Zoönomia (1794-1796), que contiene un sistema de patología y un tratado sobre la generación, en el que anticipó algunas de las ideas de Lamarck sobre la evolución.
La esencia de sus opiniones está contenida en el siguiente pasaje, que sigue con la conclusión de que un mismo tipo de filamento vivo es y ha sido la causa de toda la vida orgánica:
¿Sería demasiado atrevido imaginar que, en el gran lapso de tiempo transcurrido desde que la tierra comenzó a existir, tal vez millones de años antes del comienzo de la historia de la humanidad, sería demasiado atrevido imaginar que todos los animales de sangre caliente han surgido de un filamento vivo, que la gran Causa Primera dotó (invistió) de animalidad, con el poder de adquirir nuevas partes, acompañadas de nuevas propensiones, dirigidas por irritaciones, sensaciones, voliciones y asociaciones, y poseyendo así la facultad de continuar mejorando por su propia actividad inherente, y de entregar estas mejoras por generación a su posteridad, mundo sin fin.
Esta es una declaración clara del tipo de pensamiento evolutivo por el que se conoce a Lamarck.
Obras posteriores
La idea de la evolución de Darwin aparece en otras obras suyas. En Los amores de las plantas (1789), reimpreso en varias ediciones como El jardín botánico, aparece el comentario "¡Tal vez todas las producciones de la naturaleza están en su progreso hacia una mayor perfección!". Todas estas obras de historia natural tienen forma de poemas, por lo que no son satisfactorias desde el punto de vista de la ciencia moderna. Pero el siglo XVIII fue una época en la que los hombres inteligentes establecieron conexiones; los tipos de científicos especializados se produjeron por primera vez en vida de su nieto Carlos.
Las dos últimas hojas de A plan for the conduct of female education in boarding schools (1797), de Darwin, contienen una lista de libros, una apología de la obra y un anuncio de la "Miss Parkers School". La obra es probablemente el resultado de su relación con Mary Parker. La escuela anunciada en la última página es la que creó en Ashbourne, Derbyshire, para sus dos hijos ilegítimos, Susanna y Mary.