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Soy Andrew Ryan y estoy aquí para hacerle una pregunta:
¿No tiene el hombre derecho al sudor de su frente?
No, dice el hombre de Washington; pertenece a los pobres.
No, dice el hombre en el Vaticano; pertenece a Dios.
No, dice el hombre de Moscú; pertenece a todos.
Rechacé esas respuestas. En su lugar, elegí algo
diferente. Elegí lo imposible. Elegí...
Rapto.
Una ciudad donde el artista no temería al censor.
Donde el científico no se vería limitado por la mezquina moralidad.
Donde los grandes no se verían limitados por los pequeños.
Y con el sudor de su frente,
Rapture puede convertirse en su ciudad también
Andrew Ryan
BioShock está ambientado en el año 1960, en Rapture, una ciudad submarina ficticia. El jugador se entera de la existencia de Rapture escuchando grabaciones de voz. Rapture fue creada por un hombre llamado Andrew Ryan, al que no le gustaban los poderes políticos, económicos y religiosos que existían sobre la tierra. Quería que Rapture fuera un lugar donde la gente pudiera hacer y convertirse en lo que quisiera. La ciudad se construyó en secreto en 1946 en un lecho marino del Atlántico medio, utilizando volcanes submarinos para dar energía geotérmica. El progreso científico creció en Rapture porque no había gobiernos ni organizaciones religiosas que pudieran poner límites a la investigación. Así fue como Ryan atrajo a muchos científicos brillantes a la ciudad. Esto condujo a rápidos desarrollos en ingeniería y biotecnología. Estos científicos también descubrieron las ADAM, células madre extraídas de una especie desconocida de babosa marina, que la Dra. Bridgette Tenenbaum descubrió que tenían la capacidad de curar tejidos dañados y reescribir el genoma humano. Tenenbaum se unió al empresario y mafioso Frank Fontaine para crear la industria del plásmido, que ofrecía mejoras físicas sobrehumanas a sus clientes. Tenenbaum descubrió que el ADAM podía producirse en masa implantando las babosas en los estómagos de las jóvenes ("Hermanitas"), sacadas de los orfanatos fundados por Fontaine.
Con el paso del tiempo, la brecha entre ricos y pobres aumentó. Frank Fontaine creó organizaciones de caridad para apoyar a las clases bajas. Su objetivo era utilizar sus organizaciones de caridad para manipular a los pobres. También realizó una operación de contrabando para suministrar a los ciudadanos artículos prohibidos de la superficie, como material religioso. Esto, junto con su control de la industria de los plásmidos, le hizo inmensamente poderoso. Intentó derrocar a Ryan, pero la revuelta fue violentamente aplastada y se dijo que Fontaine había muerto. Ryan se hizo con el control del negocio de los plásmidos de Fontaine. En pocos meses, una nueva figura llamada Atlas se alzó como líder de la clase baja descontenta. En la víspera de Año Nuevo de 1959, Atlas y sus seguidores imbuidos de ADAM iniciaron una nueva revuelta contra Ryan que se extendió por todo Rapture. Ryan, a su vez, comenzó a empalmar sus propias fuerzas y su paranoia llegó a tal nivel que colgó a decenas de personas, en su mayoría inocentes, en la plaza principal de Rapture. Para solucionar la escasez de ADAM, las Little Sisters fueron condicionadas mentalmente para vagar por la ciudad y extraer ADAM de los muertos, reciclándolo en ADAM crudo en sus estómagos después de tragarlo. Los "Big Daddies", humanos mejorados y mentalmente esterilizados en trajes de buceo blindados, fueron creados por el Dr. Suchong, el científico detrás de muchos plásmidos, para proteger a las Little Sisters en su trabajo. Un inconveniente del ADAM es que el usuario debe tomar infusiones regulares o sufrir problemas mentales y físicos. Como la guerra perjudicó la producción y el suministro, todos los usuarios de ADAM de la ciudad se volvieron violentamente locos. Para cuando el jugador llega, sólo un puñado de humanos no mutados sobrevive en los escondites.
Historia
Al principio del juego, el personaje del jugador, Jack, es un pasajero de un avión que se hunde en el océano Atlántico en 1960, después de que la sociedad ordenada de Rapture se haya derrumbado. Tras salir a la superficie, Jack se encuentra como único superviviente del accidente y nada hasta un faro cercano en una isla, donde encuentra una batisfera que utiliza para hundirse en el océano y entrar en la ciudad de Rapture. Un irlandés llamado Atlas utiliza la radio de servicio encontrada en la batisfera para ayudar a Jack a ponerse a salvo. Mientras tanto, Ryan, creyendo que Jack es un agente de una nación de la superficie, utiliza los sistemas automatizados de Rapture y sus Splicers controlados por feromonas para intentar matar a Jack. Atlas le dice a Jack que la única forma de sobrevivir es utilizar las habilidades que le otorgan los plásmidos, y que debe matar a las Hermanitas para extraer su ADAM. Al oír las palabras de Atlas, el Dr. Tenenbaum intercepta a Jack y le insta a salvar a las Hermanitas, dándole un plásmido que desplazará las babosas marinas incrustadas en cada Hermana. Atlas dice que su mujer y su hijo se han escondido en un submarino y dirige a Jack hacia él. Justo cuando Jack y Atlas llegan a la bahía donde se encuentra, Ryan lo destruye; un Atlas enfadado le pide a Jack que mate a Ryan.
Finalmente, tras completar tareas como salvar un bosque artificial de la muerte y ayudar a un artista loco a construir su escultura, Jack se enfrenta a Ryan en su oficina, que está jugando al golf. Ryan le revela una verdad que él mismo ha reconstruido. Es el hijo ilegítimo de Ryan por una aventura con Jasmine Jolene, una bailarina. Cuando Jolene se quedó embarazada de Jack, ella, desesperada por el dinero, se hizo extirpar quirúrgicamente el embrión y lo vendió al mejor postor. No se dio cuenta de que fue Frank Fontaine quien compró al hijo, lo que provocó su muerte a manos de un enfadado Ryan. Ryan revela además que, tras comprar el embrión de Jack, Fontaine le obligó a obedecer órdenes cuando le dijo: "¿Serías tan amable de...?". A continuación, Jack fue enviado a la superficie cuando comenzó la guerra para ponerlo fuera del alcance de Ryan. Cuando el conflicto entre Fontaine y Ryan llegó a un punto muerto, Jack recibió instrucciones para embarcar en un vuelo con un paquete y utilizar su contenido, un revólver, para secuestrar y estrellar el avión cerca del faro, lo que le permitió regresar a Rapture como herramienta de Fontaine. Como Jack era el hijo de Ryan, podía utilizar libremente la red de batisferas de Rapture, que había sido bloqueada para todo el mundo excepto para los que estaban dentro del "parque genético" de Ryan. Finalmente, Ryan hace que Jack lo mate, queriendo morir en sus propios términos. Con la muerte de Ryan, Jack se da cuenta demasiado tarde de que Atlas también ha estado utilizando la frase desencadenante para controlarlo. Atlas se revela como Fontaine, que fingió su muerte para despistar a Ryan y tomar el control de la ciudad, dejando a Jack a merced de los sistemas de seguridad reactivados. La Dra. Tenenbaum y sus Hermanitas ayudan a Jack a escapar a través del sistema de ventilación, donde cae y pierde el conocimiento.
Cuando Jack despierta, la Dra. Tenenbaum ya ha desactivado la frase detonante. Cuando a Fontaine le queda claro que está perdiendo el control sobre Jack, Fontaine señala el hecho de que Tenenbaum ha sobrevivido tanto a la Segunda Guerra Mundial como víctima del Holocausto como a la batalla en Rapture, insinuando que tiene una agenda secreta propia. Con la ayuda de las Hermanitas, Jack consigue localizar a Fontaine. Fontaine, acorralado, se inyecta enormes cantidades de ADAM y se convierte en un monstruo. Jack lucha contra Fontaine, y finalmente vence y permite que las Hermanitas le quiten el ADAM a Fontaine, matándolo.
Hay tres finales posibles en función de cómo haya interactuado el jugador con las Hermanitas, todos ellos narrados por el Dr. Tenenbaum. Si el jugador no cosechó ninguna Hermanita (salvando así sus vidas), el final muestra a las cinco Hermanitas regresando a la superficie con Jack y viviendo vidas plenas bajo su cuidado, incluyendo su graduación en la universidad, casándose y teniendo hijos; termina en un tono reconfortante, con un Jack anciano rodeado en su lecho de muerte por las cinco Hermanitas adultas.
Si el jugador cosechó (y por tanto mató) a todas o casi todas las Hermanitas, el juego termina con Jack volviéndose contra las Hermanas después de derrotar a Fontaine, presumiblemente matándolas a todas y tomando su ADAM. Tenenbaum narra lo ocurrido, enfadando a Jack y sus acciones, con una voz espesa de ira. Más adelante, en el segundo final, un submarino de clase George Washington que transportaba misiles nucleares se encuentra con los restos del avión y de repente se ve rodeado de batisferas que contienen Splicers. Los Splicers matan a todos los tripulantes a bordo del submarino y toman el control del mismo.
Si el jugador ha matado a más de una hermanita, pero no lo suficiente como para obtener el final anterior, el final es el mismo que el segundo, pero el tono de la voz de Tenenbaum es triste, en lugar de enfadado, y hay pequeños cambios en el diálogo.