El Museo de Bellas Artes, situado en el paseo de Frai Francisco, es de especial interés. Se trata de un edificio de estilo renacentista de principios del siglo XX situado frente a Ajuria Enea, la residencia del lehendakari. En este museo hay cuadros de Ignacio Zuloaga, Joaquín Sorolla, Ignacio Díaz de Olano y Fernando Amarica.
Otra importante galería de arte es el Artium (Museo Vasco de Arte Contemporáneo) La colección permanente cuenta con obras de artistas vascos y españoles con pinturas, esculturas, grabados, fotografías y vídeos realizados por Chillida, Oteiza y Moraza, entre otros. Este moderno edificio fue inaugurado en 2002 y se encuentra en la calle Frantzia.
Bibat es un importante museo dedicado a la arqueología y a los naipes. Este museo se encuentra en un antiguo edificio renacentista de la calle Aiztogile, recientemente renovado por el arquitecto Patxi Mangado.
Hay otros museos interesantes como el Museo de las Armas en el Paseo Fray Francisco o el Museo de Ciencias Naturales en la Torre de Doña Ochanda, una casa fuerte construida en el siglo XVI, en la calle Jesusen Zerbitzarien Fundatzailean. Muy cerca se encuentra el Museo de los Faroles en la calle Zapateri.
Vitoria es también un museo al aire libre con esculturas y estatuas en sus calles de artistas contemporáneos como Oteiza, Ibarrola, Chillida, Casto Solano, Nestor Basterrechea, etc.