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HGNC: comité de nomenclatura y símbolos oficiales para genes humanos

El HGNC asigna nombres y símbolos únicos a los genes humanos, mantiene una base de datos autorizada y coordina con expertos y bases internacionales para reducir ambigüedades en investigación y clínica.

Qué es el HGNC

El Comité de Nomenclatura Genética de HUGO (HGNC) es la autoridad que asigna nombres y símbolos oficiales a los genes humanos. Su objetivo es proporcionar un nombre largo descriptivo y un símbolo corto y único para cada gen conocido, evitando duplicidades y confusiones que aparecen con nombres tradicionales o apodos históricos. El HGNC forma parte de la estructura de la Human Genome Organisation (HUGO) y publica su información en un recurso accesible públicamente sitio oficial del HGNC.

Principios básicos de la nomenclatura

Los símbolos aprobados por el HGNC están pensados para ser estables, concisos y fácilmente reconocibles por la comunidad científica y clínica. Entre los principios generales se incluyen:

  • Un símbolo único por gen para evitar ambigüedad en la literatura.
  • Uso preferente de letras latinas y números arábigos, evitando signos de puntuación innecesarios.
  • Convenciones tipográficas: por ejemplo, en la práctica editorial humana los símbolos de genes suelen escribirse en mayúsculas y en cursiva cuando se citan los genes, mientras que las proteínas derivadas se representan en mayúsculas sin cursiva.
  • Evitar símbolos que impliquen funciones o fenotipos que podrían resultar incorrectos si la biología del gen se revisa.

Proceso de asignación y mantenimiento

Para nombrar o modificar un símbolo, el HGNC consulta con expertos en el campo, revisa la bibliografía y coordina con otras bases de datos genómicas. Mantiene un registro de sinónimos y nombres antiguos para preservar la trazabilidad entre publicaciones históricas y la nomenclatura actual. Los usuarios pueden consultar directrices detalladas y solicitar nuevos símbolos o cambios mediante canales públicos descritos en las directrices de nomenclatura.

Usos y relevancia

La estandarización del nombre facilita la comunicación entre investigadores, la curación de bases de datos y la interpretación clínica de resultados genéticos. Por ejemplo, el acrónimo "CAP" ha sido históricamente ambiguo y puede referirse a varios genes distintos; el uso de un símbolo HGNC único elimina ese tipo de confusión. Las referencias a genes en bases como Ensembl o NCBI suelen incluir los símbolos aprobados por el HGNC y su identificador estable (HGNC ID), lo que ayuda a enlazar datos entre recursos. Para buscar un símbolo o comprobar aliases se puede utilizar el buscador público del comité buscador de símbolos.

Diferencias y datos relevantes

El HGNC se centra en la especie humana; otras especies tienen comités o recursos independientes con convenciones adaptadas. Además, el HGNC distingue entre tipos de locus (genes codificantes, ARN no codificante, pseudogenes, etc.) y organiza familias de genes con raíces simbólicas comunes cuando procede. Aunque los símbolos aprobados tienden a ser estables, pueden actualizarse si surge nueva evidencia funcional o por consenso comunitario. Mantener el uso de símbolos oficiales es una buena práctica para asegurar claridad en publicaciones, bases de datos y aplicaciones clínicas.

Nota: para acceder a la base de datos, consultar políticas o proponer cambios, utilice los enlaces oficiales y las páginas de contacto indicadas en los recursos del comité.

Directrices de denominación

El enfoque del HGNC para nombrar genes y asignar símbolos (abreviaturas de nombres de genes) es:

  1. los símbolos de los genes deben ser únicos
  2. los símbolos deben utilizar únicamente el alfabeto romano y los números arábigos
  3. los símbolos no deben contener signos de puntuación ni la "G" de gen
  4. los símbolos no contienen ninguna referencia a la especie en la que están codificados, es decir, "H/h" para los humanos

La descripción completa de las directrices de nomenclatura del HGNC puede encontrarse en su sitio web [2]. El HGNC aboga por los apéndices _v1, _v2,.. para distinguir entre diferentes variantes de empalme y _pr1, _pr2,.. para las variantes del promotor de un solo gen.

El HGNC también afirma que "la nomenclatura de los genes debe evolucionar con las nuevas tecnologías en lugar de ser restrictiva, como ocurre a veces cuando se aplican sistemas de nomenclatura histórica y de un solo gen".

Procedimiento

El HGNC se pone en contacto por correo electrónico con los autores que han publicado sobre el gen humano en cuestión. Se les pide su opinión sobre la nomenclatura propuesta. El HGNC también trabaja con otros conservadores de bases de datos y con expertos en familias de genes o conjuntos de genes específicos.

Revisión

Cambiar el nombre de un gen estandarizado después de que se haya establecido puede causar confusión. Por lo tanto, el mérito de tales cambios es controvertido. Por este motivo, el HGNC sólo cambia el nombre de un gen si la mayoría de los investigadores que trabajan en él están de acuerdo con el cambio.

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Preguntas y respuestas

P: ¿Cuál es el papel del Comité de Nomenclatura Genética de HUGO (HGNC)?

R: El HGNC establece un nombre único y significativo para cada gen humano conocido.

P: ¿Cómo elige el HGNC los nombres para los genes?

R: El HGNC pide la opinión de los expertos antes de dar un nombre largo y una abreviatura a cada gen.

P: ¿Cuál es la abreviatura del nombre dado a cada gen por el HGNC?

R: La abreviatura se denomina símbolo.

P: ¿Por qué los nombres y abreviaturas tradicionales de los genes no son específicos para un solo gen?

R: Los nombres y abreviaturas tradicionales de los genes pueden utilizarse para referirse a varios genes diferentes, lo que puede dar lugar a confusión.

P: ¿Cuántos símbolos genéticos da el HGNC a cada gen?

R: Los nombres abreviados de genes del HGNC, o símbolos de genes, se dan a un solo gen.

P: ¿Cuál es la ventaja de utilizar los símbolos génicos del HGNC en lugar de los nombres génicos tradicionales?

R: El uso de los símbolos génicos del HGNC reduce la confusión sobre a qué gen se está haciendo referencia.

P: ¿De qué organización forma parte el HGNC?

R: El HGNC forma parte de la Organización del Genoma Humano (HUGO).

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Autor

AlegsaOnline.com HGNC: comité de nomenclatura y símbolos oficiales para genes humanos

URL: https://es.alegsaonline.com/art/45595

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Fuentes
  • doi.org : 10.1093/nar/gkq892
  • pubmed.ncbi.nlm.nih.gov : 20929869
  • genenames.org : genenames.org
  • genenames.org : "Guidelines for human gene nomenclature. An international system for human gene nomenclature (ISGN, 1987)"
  • pubmed.ncbi.nlm.nih.gov : 3507270