OMIM: definición y base de datos de genes y trastornos humanos
OMIM: guía completa de genes humanos y trastornos — base de datos NCBI con 8.000 entradas de genes y 15.000 fenotipos para diagnóstico, investigación y descubrimiento genético.
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) es una base de datos en línea y un catálogo comprensivo de la información genética humana y de los trastornos hereditarios relacionados. Está diseñado para relacionar genes y variantes con fenotipos clínicos, y es una herramienta de referencia habitual para investigadores, genetistas clínicos y estudiantes.
OMIM contiene entradas para genes y para fenotipos (enfermedades o rasgos clínicos). Estas entradas incluyen descripciones clínicas, datos de herencia, información molecular cuando está disponible, variantes alélicas descritas en la literatura y referencias bibliográficas. En general se emplea para identificar qué genes están implicados en una enfermedad, para revisar variantes reportadas y para obtener una síntesis de la evidencia publicada.
Qué contiene y cómo se organiza
- Entradas con identificadores únicos (números MIM): cada entrada tiene un número MIM que sirve como identificador estable.
- Distinción entre genes y fenotipos: OMIM incluye tanto genes como rasgos/enfermedades. Muchas entradas describen la relación entre un gen concreto y el fenotipo que causa.
- Secciones típicas de una entrada: resumen clínico, sinopsis clínica, genética y biología molecular, variantes alélicas, diagnóstico diferencial y bibliografía.
- Curación y actualizaciones: la información se revisa y actualiza por curadores con base en la literatura científica; las entradas suelen reflejar el conocimiento y los descubrimientos más recientes.
Alcance y cifras
OMIM reúne miles de entradas: por ejemplo, en distintos informes se mencionan cifras del orden de miles de genes y decenas de miles de fenotipos y variantes. Estas cifras cambian continuamente a medida que se publican nuevos estudios y se actualizan las entradas; por eso las cifras concretas pueden variar con el tiempo.
Usos principales
- Soporte para el diagnóstico clínico y la interpretación de variantes genéticas.
- Referencia para investigación básica y traslacional (vinculación genotipo–fenotipo, patogénesis).
- Recurso educativo para estudiantes y profesionales de genética.
- Fuente de enlaces y referencias primarias para trabajos científicos y revisiones.
Cómo buscar y acceder
La forma más directa de consultar OMIM es a través de su sitio web (omim.org), buscando por nombre de gen, número MIM, sinopsis clínica o términos descriptivos del fenotipo. Muchas bases de datos y herramientas bioinformáticas, así como portales genéticos como el CentroNacionalde Información Biotecnológica (NCBI), integran enlaces a OMIM desde sus fichas de genes o de enfermedades, lo que permite encontrar rápidamente la entrada relevante.
Acceso programático y licencia
OMIM ofrece servicios y recursos para usuarios avanzados (por ejemplo, APIs o descargas para uso no comercial), pero algunos usos de los datos (especialmente redistribución o usos comerciales) pueden requerir licencias o permisos. Para integración automatizada o descarga masiva conviene consultar las condiciones de uso y, si procede, solicitar una clave de acceso o licencia.
Breve nota histórica
OMIM se originó como la continuación digital de trabajos clásicos de genética médica y ha sido desarrollado y mantenido por grupos especializados en genética humana. A lo largo del tiempo se ha convertido en una referencia estándar en medicina genética y en investigación sobre enfermedades mendelianas y multifactoriales.
En resumen, OMIM es una base de datos curada e indispensable para quienes trabajan con genes y trastornos humanos, útil tanto para la práctica clínica como para la investigación y la docencia. Para búsquedas precisas conviene usar términos estandarizados (símbolos de genes, sinónimos clínicos o números MIM) y revisar las referencias originales que acompañan cada entrada.
Versiones
La herencia mendeliana en el hombre se empezó a publicar a principios de los años sesenta. La 12ª edición es el libro más reciente. La versión en línea, OMIM, está disponible desde 1987. El NCBI la trasladó a la World Wide Web en 1995. En 2004, OMIM contenía más de 15.000 registros.
El código MIM
Cada enfermedad y cada gen tiene un número de seis dígitos. El primer dígito de cada número indica cómo se hereda el gen o la enfermedad (se transmite de una generación a otra).
Si el dígito inicial es 1, el rasgo es autosómico dominante; si 2, autosómico recesivo; si 3, ligado al X. Cada rasgo definido en este diccionario tiene un número MIM, el número de la 12ª edición de MIM. El número MIM se imprime entre corchetes con o sin un asterisco (los asteriscos indican que el modo de herencia es conocido; un símbolo de número (#) antes de un número de entrada significa que el fenotipo puede ser causado por una mutación en cualquiera de dos o más genes) según corresponda. Por ejemplo, la enfermedad de Pelizaeus-Merzbacher [MIM #312080] es un trastorno recesivo ligado al X.
Gama de códigos MIM: método de herencia
- 100000-299999: Loci o fenotipos autosómicos (creados antes del 15 de mayo de 1994)
- 300000-399999: Loci o fenotipos ligados al X
- 400000-499999: loci o fenotipos ligados al Y
- 500000-599999: Loci o fenotipos mitocondriales
- 600000-above : Loci o fenotipos autosómicos (creados después del 15 de mayo de 1994)
Estos códigos se han utilizado en la literatura médica para proporcionar un índice unificado de enfermedades genéticas.
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