Protein Data Bank
El Banco de Datos de Proteínas (PDB) es una colección de información sobre la estructura tridimensional (3-D) de grandes moléculas biológicas, como las proteínas y los ácidos nucleicos. Biólogos y bioquímicos de todo el mundo envían los datos. La mayoría de los datos proceden de la cristalografía de rayos X o la espectroscopia de RMN. Cualquiera puede acceder al PDB de forma gratuita en línea. El Worldwide Protein Data Bank, wwPDB, gestiona el PDB.
El PDB es útil para los científicos que estudian la biología estructural y la genómica estructural. Muchos científicos tienen que enviar su información a la base de datos. Las principales revistas científicas y algunos organismos de financiación, como los Institutos Nacionales de Salud de Estados Unidos, tienen normas que obligan a los científicos a enviar los datos al PDB. La PDB tiene los datos originales o primarios. Otros cientos de bases de datos reutilizan los datos. Estas bases de datos secundarias organizan la información de diferentes maneras. Por ejemplo, tanto SCOP como CATH colocan las estructuras en grupos organizados por tipo de estructura e ideas sobre cómo se relacionan a través de la evolución. La ontología genética agrupa los datos en función de los genes.
Páginas relacionadas
- Base de datos de movimientos moleculares
- The Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) - sitio principal de los hosts regionales (abajo)
- Banco de datos de proteínas RCSB (EE.UU.)
- PDBe (Europa)
- PDBj (Japón)
- BMRB, Banco de Datos de Resonancia Magnética Biológica (EEUU)
- wwPDB Documentation - documentación sobre los formatos de archivo PDB y PDBML
- Mirando las estructuras - La introducción del RCSB a la cristalografía
- Página de inicio de PDBsum - Extrae datos de otras bases de datos sobre estructuras PDB.
- Base de datos de ácidos nucleicos, NDB - una réplica de la PDB especialmente para la búsqueda de ácidos nucleicos
- Tutorial de introducción al PDB patrocinado por el PDB
Preguntas y respuestas
P: ¿Qué es el Banco de Datos de Proteínas (PDB)?
R: El Banco de Datos de Proteínas (PDB) es una colección de información sobre la estructura tridimensional (3-D) de grandes moléculas biológicas, como las proteínas y los ácidos nucleicos.
P: ¿De dónde proceden los datos del PDB?
R: La mayoría de los datos proceden de la cristalografía de rayos X o de la espectroscopia de RMN.
P: ¿Quién envía los datos para la PDB?
R: Biólogos y bioquímicos de todo el mundo envían los datos.
P: ¿Cualquiera puede acceder a la PDB?
R: Sí, cualquiera puede acceder al PDB gratuitamente en línea.
P: ¿Quién gestiona el PDB?
R: El Banco Mundial de Datos de Proteínas (wwPDB) gestiona el PDB.
P: ¿Por qué es útil el PDB para los científicos?
R: El PDB es útil para los científicos que estudian la biología estructural y la genómica estructural.
P: ¿Quién envía su información al PDB?
R: Muchos científicos tienen que enviar su información a la base de datos. Las principales revistas científicas y algunos organismos de financiación, como los Institutos Nacionales de Salud de Estados Unidos, tienen normas que obligan a los científicos a enviar los datos al PDB.
