La actual Universidad de Zhejiang se formó oficialmente en 1998, pero su raíz principal, la Academia Qiushi, se remonta a 1897 en la dinastía Qing. En aquella época, la Academia Qiushi fue una de las primeras academias modernas de educación superior en China. Entre 1901 y 1927, el nombre de la Academia Qiushi cambió muchas veces como Academia Zhejiang, Colegio Avanzado Zhejiang, Academia Yuying, etc. En 1928, recibió el nombre oficial de Universidad Nacional de Zhejiang. Tras el estallido de la Guerra de Resistencia contra Japón en 1937, la Universidad de Zhejiang comenzó a trasladarse al oeste de China, lo que se denomina "Larga Marcha de la Cultura". Bajo la dirección de Chu Kochen, la Universidad de Zhejiang se dirigió hacia una de las principales universidades de China y alcanzó una serie de logros en la enseñanza y la investigación. Y en 1944, fue honrada como "Cambridge Oriental" por Joseph Needham, el famoso erudito británico que visitó la Universidad de Zhejiang dos veces. Cuando la resistencia contra Japón llegó a su fin, la Universidad de Zhejiang se trasladó de nuevo a Hangzhou en 1946 y en 1951 ya se convirtió en una universidad integral. En 1952, debido a la renovación nacional de los sistemas educativos, la Universidad de Zhejiang fue reestructurada y separada en 15 instituciones. Hasta que las cuatro universidades con el mismo semestre se fusionaron en la nueva Universidad de Zhejiang en 1998, la Universidad de Zhejiang, la Universidad de Hangzhou, la Universidad Agrícola de Zhejiang y la Universidad Médica de Zhejiang se centraron en la investigación y la enseñanza en su propio campo y formaron a un gran número de destacados profesionales. Y finalmente, el 15 de septiembre de 1998, se formó la nueva Universidad de Zhejiang, que se desarrolló rápidamente durante los últimos 12 años y se esforzó por construirse como una de las universidades de primera clase en el mundo.